Aun cuando no existe ningún tipo de restricciones para las líneas de investigación a desarrollar en el Instituto, se ha procurado que las que se lleven a cabo estén relacionadas con las más adecuadas a la realidad del país. Las líneas de investigación se han seleccionado de acuerdo con la tradición de investigación del Laboratorio Xeolóxico de Laxe y con la trayectoria profesional de los miembros del Instituto. A continuación se enumeran las líneas que se están desarrolando en el momento actual: -Investigación en los cambios en las comunidades faunísticas fósiles. -Estudio de los cambios en el nivel del mar en la costa de Galicia durante el Cenozoico. -Cambios paleoambientales fósiles basados en criterios sedimentológicos, edafológicos, geomorfológicos y paleontológicos. -Investigación para la elaboración de mapas de riesgos geológicos, mapas geomorfológicos, evolución del medio ambiente cenozoico. -Estudios de impacto ambiental realizados por las Obras Públicas y la Minería. -Investigación sobre conservación de suelos orientada hacia la agricultura o el medio ambiente. -Evaluación de recursos naturales: minería, paisaje, puntos de interés científico y didáctico, puntos de interés geológico-paleontológico, localización de ubicaciones originales de los materiales pétreos para la construcción de monumentos.