A formación inicial e continua do profesorado de Secundaria é a Misión da UENU. Nos primeiros anos de vida do CUFIE coordinar o CAP ten sido un dos seus principias cometidos. Máis coa reforma da formación inicial do profesorado de Secundaria, creouse o Mestrado en Profesorado de ESO e Bacharelato, Formación Profesional e Ensinanza de Idiomas, adscrito á Facultade de Ciencias da Educación.

A Visión da UENU amplía os seus cometidos á formación continua do profesorado non universitario e ao establecemento de canles de comunicación e colaboración cos centros de Ensino Secundario, sobre todo no que respecta aos retos que formula o Espazo Europeo de Ensino Superior (EEES).

Neste intre o campo de traballo da UENU céntrase no Plano de Formación para o Ensino en Secundaria (PFES).

O PFES é un plano de organización e desenvolvemento de cursos de especialización e perfeccionamento para o profesorado de Secundaria. Este plano elaborouse pensando nas necesidades manifestadas polo propio profesorado que está a iniciar a súa andaina profesional no Ensino Secundario. Necesidades que evidencian a urxencia de recibir unha oferta formativa dirixida á adquisición de destrezas e coñecementos didácticos e metodolóxicos, así como o uso racional das TIC nas aulas de Educación Secundaria.